El Nano Battalion cuenta con un ecualizador de tres bandas con tres modos de posición de ecualizador para brindar máxima flexibilidad y control de modelado de sonido. El EQ de tres bandas incluye los controles de Agudos (boost/atenuación por encima de 1kHz) y Graves (boost/atenuación por debajo de 200Hz), más un switch Mid que proporciona un boost o atenuación de 9dB a 500Hz. Tres opciones de trayectoria de señal determinan dónde se aplica el EQ. En el modo Distortion, el EQ viene después de la señal distorsionada y tiene un efecto poderoso en su timbre mientras que la señal limpia no se ve afectada. En el modo Input, el EQ va primero en la trayectoria de la señal que afecta a la señal limpia y a la distorsionada. Boostear frecuencias en este modo puede llevar la distorsión a un estado más saturado. En el modo Dry, el EQ afecta a la señal limpia, pero no a la señal distorsionada.